周垣很满意地点点头，“看来大家的认识都蛮高的嘛，这说明我们的党建工作是卓有成效的。”随后话锋一转，说道，“现在我们面临着一个重要的问题，就是如何处理我党和华夏军的关系，以及今后如何让投诚、投降军队服从党的领导。“
众人忙正襟危坐，洗耳恭听。
周垣说道，“朕认为，我们治军的原则是党指挥枪，而决不容许枪指挥党，坚持党指挥枪、即党对军队的绝对领导原则的基本精神：一是华夏军必须完全地绝对地无条件地置于华兴党的领导之下，任何情况下，决不允许军队闹独立性，决不允许任何个人向党争兵权；根据党指挥枪的原则，民族自治机关不得组建任何一支武装力量。二是除华兴党和她的助手—华兴党青年团的组织，可以根据华兴党中央委员会的指示在军队中工作以外，其他政党都不得在军队中发展和开展工作；三是华夏军的一切活动都必须服从于和服务于党的纲领、路线、方针、政策。“党指挥枪”是华夏军的建军之本，立军之魂，无论什么时候都不能有丝毫的动摇。“
在座的都是些人中之龙，立刻明白皇帝陛下的意思。这是向那些地方实力派收权的前兆，同时也是为了避免军队以武力要挟中央政府和养兵自重，军阀割据。
但是，地方的那些实力派会同意吗？丁正、多铎、豪格等人表示了他们的担心。
“脓疮,总要挤出来。”翁济世说道，“我们不能养痈贻患，为了保证党对军队的绝对领导，我们有必要对那些朝秦暮楚，三心二意的地方势力以及他们的军队，进行大清洗。只有肃清地方割据势力的流毒，我们的军队才会纯洁。”
范文程说道，“如今在帝国境内，很多实力派能够发动武装叛乱，最根本原因，就是那些地方的自治势力，拥有武装力量。而这是严重违背了党指挥枪的原则滴。”
“无论在什么地方？也无论是什么样的武装。只要违背了党指挥枪的原则，就是武装叛乱。对于任何形式的武装叛乱，一经发现，绝不姑息。”
南亚次大陆阿萨姆和那加兰地区。
自从华夏军部队陆续进驻布拉马普特拉河流域，盘踞在阿萨姆一带的部落酋长和土王，在帝国政府做出保证他们人身生命安全的许诺后，便纷纷表示愿意投诚。
对投诚过来的土著军队，华夏军的方针是：下级军官士兵全部编入生产建设兵团，开赴非洲或者其他地区。那些高级将领则编入“华夏军军官训练班”集中培训，等培训结束之后，异地使用。如果不愿意参加华夏军，则发放遣散费，回家务农。
周垣提出党指挥枪的原则，让阿萨姆土著上层头人惶恐不安，他们不愿意失去权力和荣华富贵，反对交出军队，于是勾结反动阿三脚教主密谋策划，公开进行武装叛乱。
图方格阿恩杰华夏军哨所首先被叛军包围。我华夏军战士们依靠坚固的工事，打退叛军的多次进攻，最后寡不敌众，全部战死。随后万余叛匪围攻科奇比哈尔城数日，袭击集体农庄，抢夺粮食和牲畜，破坏公路和桥梁。单单是科奇比哈尔，就有一万多名土著阿三部落参加叛乱，华夏军以及集体农庄、集体牧场，有500多人在被叛军杀害。
周垣大为震怒，命令阿萨姆军区步兵师第53炮团、骑兵第四师、
以及孟加拉省军分区14个营、不丹省军区两个师，及各县守备部队、集体农庄的民兵部队，共同平息叛乱。
经过多次激战，击毙14000多人，俘虏2万多名。
为了惩戒犯罪分子，周垣命令将俘虏交给卡托加管理局，去高原省柴达木盐湖、澳大利亚的铁矿、巴西的热带雨林，去接受劳动改造。那些叛军家属，全部分配给生产建设兵团的战士。
阿萨姆武装叛乱的同时，特里普拉地区山区的各个部落联合发动叛乱，参加叛乱的人数有近万人。
周垣命令驻曼德勒的军队第135师、骑兵第12、14师、第11摩托化步兵师入特里普拉地区平叛，孟加拉省军区公安第九旅的六个团以及吉大港地区第543特战大队以及飞艇部队，对以阿加尔塔拉为中心地区进行全面清剿。
经过两个半月的浴血奋战，华夏军迅速平息了叛乱，歼灭14000多人。
卡托加管理局将反社会的暴民，赶紧进一个山洞。全部活埋。曾经在特里普拉地区各地猖狂一时的土司头人叛匪被全部肃清。在残酷激烈的平叛战场，叛军被击毙近万人。而我军也付出了沉重的代价，仅孟加拉省军区在平叛战斗中伤亡就达1200多人，其中阵亡达580人。
平定阿萨姆和特里普拉地区地方割据势力叛乱之后，周垣下令将部队的指挥权收回华兴党所有，并下令将支部建在连上。实行班、排设党小组，连队成立党支部，营、团建立党委的制度，使党组织成为部队统一领导的核心，奠定了党对军队绝对领导的组织基础。
喜马拉雅山南麓的叛乱刚平息，北麓硝烟又起。
喀尔喀蒙古却图汗野心膨胀，上书给皇帝，想做青海王。周垣毫不客气的严词拒绝。
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