这让热情开朗的明日香性格开始扭曲。外表火辣其实是为了隐藏内心的悲伤。
除了鱼天使跟胎天使其他三个使徒所攻击的目标，都是‘第三新东京市’，这个藏有‘莉莉丝’的地方。作为预定好迎击使徒的战场，‘第三新东京市’很好的履行了这个义务。李舍在这段时间内，很好的扮演好一个普通民众的角色。每当使徒攻击‘第三新东京市’的时候，李舍总会随着平民一起被疏散到那些紧急避难掩体当中。就算这样，那些按照碇源渡命令要监视李舍的特工们依旧没有放弃。李舍进入到紧急避难掩体当中的时候，那些特工也会混迹在人群中盯着李舍。每当使徒的袭击被EVA打败后，幸存下来的人们看到的便是‘第三新东京市’那满目疮痍的样貌。不过在联合国政府的人力财力支持下，那些被使徒毁灭的建筑物，在短短的时间内就会重新建好。已经形成了流水线一样的生产车间，能够将这些钢筋水泥建筑物像产品一样分批制作，再有那些能够运送上百吨重物的运输机将着一个个钢筋水泥模块搭接成一栋栋高楼大厦。
恐怖天使这个肉眼难以看见的使徒，以细菌状态直接攻击NERV总部，并且启动了NERV‘人工智能’电脑当中的自爆程序。不过好在NERV的‘人工智能’电脑，是以赤木尚子为蓝本设计的。作为赤木尚子的女儿，赤木律子通过对母亲的了解，将使徒引入程序内的‘进化’程序。‘进化’的终点便是毁灭，用这个方法消灭了这个看不见摸不着的使徒。
美穗看着在最后时刻将恐怖天使消灭的赤木律子，脸上也露出释怀的笑容。虽然在被李舍传承成为‘红眼僵尸王’的时候，获得了关于《新世纪福音战士》整个世界的运行轨迹的记忆，可是当身临其境的时候，随着时间的流逝，NERV总部的自爆程序就像一个定时炸弹，一个威力能将占地上千公顷的‘第三新东京市’送上天的炸弹。站在NERV当中，美穗心里依然捏了把汗。
“老师永远是最棒的！律子..你有一个很好的母亲呢..”美穗淡淡的说道。
赤木律子没有言语，眼角的泪水似乎述说着对母亲的思念。
平时大大咧咧的葛城美里看到好友伤心的样子，只能默默的递上一颗香烟。“过去了就让他过去吧。有些东西，放在心里就够了！”葛城美里淡淡的说道。
赤木律子，擦了把眼角的泪水，勉强露出一个笑容。伸了个懒腰，大声嚷嚷道；“呼!!今天晚上，我要去放松一下！美穗，好久没有见到你家的那位帅哥咯，我都有点想念他了！”
美穗耸了耸肩，竖起大拇指说道“没问题！今天晚上我让那个死鬼把所有的鸡尾酒都给你调一遍。酒水管够！喝道趴下为止！”
美穗看起来似乎想要安慰好友，可是心里却想着，也许这是最后一次跟自己两个好姐妹狂欢了吧。当恐怖天使袭击过后，加持良治将会潜入NERV最深处的密室，那里正是禁锢着‘莉莉丝’的地方，那里有李舍需要的‘朗基努斯之矛’。等李舍拿到想要的东西，也许就是离开的时候了。
美穗跟赤木律子还有葛城美里三人勾肩搭背的朝门外走去，闲聊起许多过去的话题。迎面而来的碇源渡看到三人后，朝着破解这次危机的赤木律子点了点头。淡淡的说道“做的好！”说完便转身离开。
对于生机最为敏感的‘僵尸’、‘旱魃’一族的美穗则双眼一缩，死死的盯住碇源渡的背影。NERV的‘人工智能’终输系统的机房，可是NERV总部内防护最为严密的地方。就连墙壁都是由高强度金属焊接而成。外部还采用了隔缘材料制成，厚厚的金属钢板达到了两百公分的厚度。在这狭小的空间内，美穗感觉到了一股跟EVA一般的气息，或者说是‘莉莉丝’这个使徒复制体的气息。
脑域被开发到了百分之四十的美穗，脑中飞速的将所有的蛛丝马迹联系起来。“哼！碇源渡，你隐藏的很深呢。没想到你居然在自己身上移植了‘莉莉丝’的细胞，现在看来还成功了呢。抛弃妻子将碇唯、碇真嗣都当成了你的棋子，并不是你对人类未来的无私奉献！而是为了完成你自己成‘神’的野心罢了！真是虚伪的凡人呢。”美穗暗骂道。盯着碇源渡的背影，眼中闪过一道寒光。碇源渡这个将碇唯、碇真嗣作为工具一般使用，妄图用所有人的生命当做赌注的男人，让美穗起了杀意。
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