在城头守军惴惴不安地等待了一个多小时之后，出城侦察的游骑兵总算是带回了令人振奋的消息——马打蓝军正在登船离开港口，而且撤离得非常彻底，因为他们临走前将那些昨天幸免于火灾的港口建筑物也统统付之一炬。显然马打蓝人已经放弃了占领巴达维亚港的打算，毁掉港口设施，一方面是不甘的泄愤，另一方面也是为了给荷兰人日后的重建工程带来更多的麻烦。
为了确保马打蓝人不是故弄玄虚，范迪门又派出几队人出城，分别前往城外各个方向查探。随后各路传回来的消息都很一致，马打蓝人的确是撤了，不过他们搜刮干净了城外的一切物资，所有的种植园和农庄都被损毁，没有来得及撤入城内的百姓除了极少数老弱之外，几乎悉数都被掳走。看得出马打蓝人是要借助这样的方式来尽可能增加巴达维亚的经济损失，不过范迪门现在可顾不上惋惜，能够虎口脱险死里逃生，就已经是一件十分值得庆幸的事情了。话说回来，类似的事情在前几年已经发生过两次，对于马打蓝人在撤离时会采取的破坏措施，范迪门其实在此之前就有了心理准备。
当天下午，游弋于外海的荷兰舰队在察觉到马打蓝人已经乘船撤退之后，终于是派出几艘船回到港口，然后跟巴达维亚城取得了联系。舰队分出了一半的武装人员登陆进入巴达维亚城，以协助议事会和军方维持城内的战后秩序。
这场持续了三十多天的交战，最终的结果仍然是与前两次一样，马打蓝军忍气吞声地选择了主动撤退。当然这个结果也并不能说是荷兰人的胜利，这次交锋已经是被对手破城而入，东印度公司和巴达维亚城所蒙受的损失远远超出了前两次荷马战争的总和，而且其负面影响也会持续很长的时间。
尽管具体的财产损失统计大概还需要一段时间才能出来，但大体的状况一眼就能看到。巴达维亚港几乎已经变成一片废墟，港口所有的建筑基本都被损毁，要完全恢复港口旧貌，保守估计也得半年以上的工期。另外巴达维亚城外大量的种植园和农庄被毁，这些种植热带水果、香料为主的田地要重新恢复生产，所需的时间可能要比重建港口更长。
还有一个损毁严重的地方就是巴达维亚城的城防体系，特别是北面城墙，有多处城墙已经在连日鏖战中塌陷，失去了应有的功用。东印度公司前两年花费巨资在城外增筑的堡垒虽然为这次防御战立下大功，但也全都在交战中化作了瓦砾废墟。马打蓝军破城之后，双方在城内街道上展开的连日街头交战，也损坏了大量的城内建筑，特别是城市中心的议事会城堡周围两三百米范围内，几乎已经看不到任何一栋完好无损的建筑物。荷兰人要想重建这些区域，所需花费的财富也绝非小数目。
除了这些一眼就能看到的损失之外，另一个不可忽略的损失，便是本地人口在这场战争中的损耗。如果把死伤、逃难、被敌军掳掠的人口粗略加到一起，那么这场战争给巴达维亚当地带来的人口损失至少上万。而且损失的人口中有相当一部分都是青壮男子，这对于战后需要投入大量劳力的重建工作来说，要算是一个不小的噩耗了。
此外连日交战中有大量的尸体都被抛弃在城内外来不及掩埋，极易在战后引起疫病爆发。还有本地的粮食补给也已宣告中断，存粮所能维持的时间也很有限。诸如此类的麻烦事还有很多，对于东印度公司来说，战后的巴达维亚可以说是一个非常难以收拾的烂摊子。
经济上的损失倒还好，毕竟只要地方还在，东印度公司就能依靠继续经营东西方之间的海上贸易来获利，巴达维亚迟早都能恢复南洋贸易中心的地位，再说趁着马打蓝主力尽出疯狂袭击南洋各地港口的这支荷兰舰队，也着实在这一个月的时间里捞到了不少真金白银。虽然未必见得能完全弥补巴达维亚所蒙受的损失，但多少也能补贴上一部分重建工程开支了。
当然对战后乱局感到头疼的只是一些高层人士，绝大部分的普通百姓仍然很庆幸自己能够平安地活到战争结束。成大朋虽然经历过更为严重的战乱，并且在这次这次的巴达维亚攻防战中并没有遭遇什么大难，但近一个月的时间里仍然让他重温了劫后余生的感觉。大成米行在这场劫难中算是非常幸运，没有出现人员上的伤亡和大的财产损失，虽然战前就被议事会查封并运走了大部分的粮食，但这些粮食也并非无偿征用，战后肯定还是会慢慢算清账目。这也幸好是荷兰人打胜了，要是败了，这些粮食肯定一粒都别想再讨回来了。
马打蓝人还急匆匆地派了一支船队，让米行的人带路去占城买粮，不过这支船队大概不会有机会回到巴达维亚了。因为在战争结束的当晚，巴特就找上门来，对成大朋做出了同样的要求，希望他能够尽快北上组织购买一批粮食运回巴达维亚。至于船只方面，议事会将从刚刚杀回来的荷兰舰队中挑选四五条船况较好的商船让成大朋使用。
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