因为撤退及时，加上做好了完全的措施，在巴塞河东岸和军队内部并没有爆发瘟疫，但是在这半个多月来，秦、日不管地带，巴塞河东到澜沧江以西的广大区域瘟疫肆虐，人和畜牲成批的死去。
不要说派去侦查疫情的人了，就是飞机在天上侦查都可以看到大量的死尸，王汉章非常担心瘟疫会传到秦国，因此不得不每天让士兵消毒，同时不得和靠近巴塞河边上的水，另外水一定要烧开才喝，关系到将士们的性命，将士们到是非常的配合。
不过半个月来，瘟疫越来越严重，虽然有河流隔开，但是连动物都会传染，王汉章不得不防，王汉章在6月10日便下令，巴塞河东岸五十里内的人全部迁移，而且是迅速的迁移，王汉章只给军队一个礼拜，不走的格杀勿论，离开的将可以得到安置。
巴塞河中下游土壤肥沃，也是原来泰国最繁华的地区，居住这大量的人口，要是瘟疫一旦传过来，那死的不仅是土著，还有王汉章的军队，另外还有不少的华侨，此地人口也是非常的密集，依照秦国的实力，一旦瘟疫爆发，恐怕没有防治的能力，因此从源头上杜绝是防止瘟疫爆发的最好办法。
到了王汉章发行货币的时候，人员基本离开，军队给他们两个选择一时去东边接受安置，另一个是去河西的瘟疫区，第三个就是被当场诛杀，土著们很清楚现在只有东边或者的可能性最大，看着中国军队凶神恶煞的样子，他们想要张口的话也吞进了嘴里。
仅仅这一下就有一百多万人需要安置，还好把印度人赶走之后留下了数额巨大的粮食，要不然真的不知道怎么办了，原本大家建议让这些土著带着粮食离开，不过王汉章认为那样的话不知道要多久了，恐怕瘟疫正好感染了他们，所以只让这些人带着少数衣物和他们认为重要的东西立即离开。
在澜沧江以东的日军做的事情也跟秦国做的差不多，石原四郎经常派出他的防化兵去检验疫情，看看自己研究的成果怎么样。
另外他们也在江东进行消毒，当然他不是在乎土著的性命，他是在乎自己的士兵，如果瘟疫蔓延过来也不好，土著也不能死光了，这写土著现在存在下去至少可以提供更多的粮食给日本，总不能死光了之后要军队去种粮。
石原四郎看着部下的报告，他对实验的效果很满意，他的研究确实非常的有效，在他认为日本有着这种武器，那任何人都会胆寒。
如果瘟疫区的土著们不走在瘟疫区等死，那日后秦、日双方可以在几个月后去接收这些干净的土地，不过土著们明显不是那种坐以待毙的傻子，瘟疫蔓延后，胆量的有钱土著纷纷找船离开，另外还有一些土著们合伙造船离开那片土地。
华军还没有打过来，日本人就跑了，后来华军来了就走了，另外从越南来了大量的难民，经过半个月的时间，现在土著们都知道了，原来是日本人搞的鬼，日本人给越南人注射了瘟疫，然后把这些越南人赶到他们的土地，继而祸害他们，这些最开始是由一些土著医生和警察联合推断出来的，他们告诉了亲朋好友，他们的亲朋好友在告诉他们的亲朋好友，事情就这样传开了。
随着瘟疫无法遏制，不管愿意不愿意离开，都得离开，离开去哪里都是人生地不熟的，不过离开要是是九死一生，恐怕不离开是十死无生了，这场瘟疫太厉害了。
特别是那些有些钱财的人，瘟疫弄不弄死他或许还不好说，但是瘟疫爆发后，穷人变得焦躁起来，政府也已经完全瘫痪，他们这些人自然成为了众矢之的，有仇的报仇，没仇的也看上他们家的娇妻美眷，粮食、钱财。
另外一些胆大的土著已经结合起来，他们当中还有一些以前的警察或者军队，他们想要离开这里，但是去哪里不要钱呢，因此这个时候要想弄到钱只有吃大户了。
现在所有人都把富户当初眼中钉肉中刺、肥羊，土著们就像发了狂的牲口随时张开他们携带病毒的血盆大口吞噬这些有钱人。
许多有些危机感的富户已经离开，那些没有离开的有的已经被消灭了，有的则和其他富户联合起来，结寨自保，不过看着外面的局势越来越不受控制，他们也终于下定决心离开。
土著们能离开的陆陆续续的离开，他们前往印尼甚至菲律宾，还有马来半岛，虽然这些地方都在日本的控制之下，但是日本人并没有对这些地方进行任何的防护、控制，日本人压根没想过瘟疫会传染到这些地方，石原四郎没想过这个问题，他只关心他的研究成果。
日本军部和在越南的日军高级将领也没有想过，他们的心思开始沉浸在用瘟疫消灭秦军和远征军几十万人，后来计划失败，他们沉浸在自责和杀戮当中。
6月中下旬，先期离开的土著们抵达了东南亚各岛，他们有些人是开始离开并没有染上病毒，但是随着抵达的人越来越多，离开瘟疫区的人越来越多，终究还是有不少携带了病毒的人离开瘟疫区到了印尼、菲律宾、马来亚等地。
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