而船队的总指挥是由吴全福出任，他也是商毅的老部下，儿女都在南京政府中出任重要职位，有着非常丰富的航海经验，和指挥船队的能力，也很让人放心，他的副手是女婿何沙。
这次出访代表团里有士兵七百二十七人，军队的主将由安徳烈担任，虽然他的年纪并不大，但能力和经验都足以让人放心。
另外出访的人员中，还林之洋的小儿子林旭进，今年他己经年满二十，小时候接受过中国传统的教育，后来又在浙江师范大学里学习过新式课，这两年开始跟着林之洋学习经商，在马尼拉竞卖西班牙资产的时侯，就是甴他代表林家出面，拍下来的三处资产都很不错。这一次也是林之洋向商毅请求，让他出去历练一下。商毅当然也没有拒绝，同时也让林旭进到英国去考察一下商机，估计中国还能在英国出售什么商品。
代表团的其他人员中，除了水手、船员、士兵、通译等人员之外，还有各种工匠、画师、医士、学者等，共有一百一十三人，军校和其他学校的学员共有二十七人。这些人都是通过招募而来，其中有一些人是对海外的世界感兴趣，也有相当一部份是冲着丰厚的报酬和发展前途而来。
征招参加出使团的人员，首先将得一笔十分丰厚的安家费用，等回航之后，又将得到一笔奖金，同时回来之后，毎个人都将会得到政府安置相应的职位。而如果船队在中途发生意外，在五年之后，船队仍未归，家人则可以来领取这份奖金。
当然还有几名特殊的人员，就是耶稣会的传教士。
对于商毅的这一决定，传教士们是绝对支持的，同时商毅要完成的访问计划，也需要传教士的全力帮助，同时汤若望也打算借这个机会，向总部进行一次全面汇报中国的传教形势和发展前景，同时也希望总部能够再多派遣一些传教士到中国来，帮助这边进一步扩士传教事业。
另外中国占领了吕宋之后，将整个吕宋的传教权力全部划给了耶稣会，但当初马尼拉大教区的传教区域划分，是由罗马天主教廷批准的，虽说现在罗马教廷己经管不了马尼拉，但还是需要向教廷通告一声，最好能够得到教廷的确认。还有商毅向教廷发出的两封信，由其是第二封控告信，也还需要传教士们去从中周旋。
因此汤若望等人经过了详细的商议之后，终于决定，这一次甴阿科尼亚带队，和另外四名传教士，一起返回欧州，向耶稣会的总部，以及罗马教会报告。而吕宋耶稣会方面也派出了四名传教士，随阿科尼亚一起同行。
而在出航之前，商毅对出行的人员提出三点要求：一是出访欧州，只谈文化交流，除了和西班牙之外，其他各国均不谈政治，也不干涉欧州各国之间的关糸，保持中立态度；二是尊重欧州各囯的风俗、传统、文化习惯和各囯釆用的政治体制，不要以天朝上国的高傲态度自居，更不要用中国的标准强加于他国。在向欧州各国传插中华文明时，不许对欧州文明进行攻击性的评价。三是尽量多与欧州各国人员进行全方位的交流，多看、多听、多记、多画，将自己在欧州的所看、所听的见闻全都尽全力记下来、画下来，等归国之后进行整理，然后结集出版。
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