虽然武田信玄、武田信廉、曾根昌世等人在殿军迹部胜资、马场信赖等人的拼死牵制上杉军后，得以逃回了踯躇崎馆。
但是武田信玄深知踯躇崎馆根本就不适合笼城固守，随即一把火将踯躇崎馆烧了，自己率残部二十余人退回了要害山城之中。
上杉辉虎和八条景定则并不打算给武田信玄一丝喘息之机，认为“亡虎不可不狩”，当即派兵对武田家在甲斐最后的一处据点要害山城进一步缩小了包围圈，并派出大量兵力进入要害山城周边的群山之中，以防武田信玄逃出要害山城。
就在武田家即将覆灭之时，贪生怕死的武田信廉却在最关键的时刻弃武田信玄而去。在他看来，上杉军的目标不过是武田信玄以及家中主战派的家臣罢了，只要自己能保全生命，等到上杉军的大军撤出甲斐一国后，那么自己作为武田信虎的嫡男，就能名正言顺的继任甲斐源氏栋梁、武田家家督等职了。
于是，武田信廉就以自己对要害山城周边群山的熟悉，接连翻越了切差城山、带那山，之后进入荒无人烟的野猿谷中藏匿。
但是武田信廉的小算盘打得再好，可还是小看了上杉军的追捕力度，他仅仅比兄长武田信玄多活了十天的时间，之后就被胜沼信就搜出斩首。
弘治二年，十一月六日，清晨。
随着辉虎的一声令下，上杉军从要害山城的四个方向同时发起了攻击。只见上杉军各部如同怒涛奔流，汹涌攻破要害山城的大手门，并大量涌入城中。
最后关头仍然没有抛弃武田信玄的秋山信藤（秋山信友之弟）、秋山越前守（御圣道样众、海野信亲家臣）、曾根昌世、工藤市兵卫（百足众）、小杉左近等人向上杉军展现了甲斐武士最后的刚毅忠诚。
秋山信藤、秋山越前守、曾根昌世、工藤市兵卫等人为了给武田信玄以及武田一族女卷体面自尽的机会，便纷纷拔刀与如同黑色潮水一般涌入城中的上杉军展开激烈的混战。虽然他们舍生忘死的向从大手门涌入城中的上杉军发起突击，并一度击退了上杉军的攻势，但是他们随后就被赶来的上杉军铁炮队打成了筛子，无一人存活。
其中，小杉左近、小平木工允等人也是为了能给武田信玄以及其家卷争取到足够的时间来自尽，便用弓失和打刀不断在要害山城周边的山林之中袭击上杉军的落单足轻、武士，并扰乱上杉军的攻势。但是最终因寡不敌众，他们在斩杀了上百名上杉军足轻、武士后还是没能达到其预期的目的而壮烈阵亡。
尽管武田军仅剩的兵力进行着顽强抵抗，逐楼逐屋皆有战，但在上杉军的绝对优势兵力强攻之下，三之丸、二之丸、追手门等地仍然接连陷落。同时，武田家家督、甲斐源氏栋梁武田信玄的人生也终究抵达了终章。
在秋山信藤、秋山越前守、曾根昌世、工藤市兵卫、小杉右近等人的不断奋战之下，武田信玄先是含泪斩下了前不久因患病而失明的次男海野信亲（海野龙芳）的头颅，而后自己就立即将上衣褪去，准备在小宫山昌友的介错下切腹自尽。
如今，充斥在武田信玄心里的，是其先祖新罗三郎义光以来，延续了二十余代的源氏一门，就这样葬送在自己的手上。可为什么会直接葬送在自己的手中呢？
一想到这里，武田信玄全身的血液都快凝固了——难道自己竟是这样一个不肖之子、亡国之主吗？这些似乎都像命中所注定的那样。八幡太郎义家、新罗三郎义光兄弟二人那可都是在刀光剑影之中才创建的这份家业。附着在太刀、大铠之上的诅咒如今终于应验了，最终出现了武田家如此悲惨的结局。
甲斐武田源自清河源氏义光流。平安末期八幡太郎源义家奋战陆奥，弟弟新罗三郎源义光封官挂印，千里走单骑援助兄长，兄弟二人同心协力制服造反的虾夷酋帅，立下了不世功勋。源义光之子源义清起初定居常陆国那珂郡武田乡，便以地名作为苗字。源义清、源清光父子后来迁居甲斐国市河庄，子孙繁衍生息，武田氏于是成为甲斐诸源氏的领袖。
最后，武田信玄怀着无限的愤恨之情，将早就写好的辞世诗（此身此骨归天地，不沾红尘自风流）放在身边，而后手持短刀用尽全身力气刺进了自己的腹部，而他身后站着的小宫山昌友则是眼疾手快，干净利落的一刀斩下了自己主君武田信玄的头颅。
小宫山昌友在将武田信玄的首级埋在要害山城本丸庭院的花坛里后，就在不远处的白砂石上独自切腹自尽了。
就这样，一度雄霸甲斐、信浓两国的战国大名、清和源氏新罗三郎义光嫡传的武家名门——甲斐武田家如今终于走到了尽头······
之后，武田信玄的正室三条夫人也不愿让武田信玄孤零零的前往三途河，她在全程看完自己丈夫切腹自尽后就举起熠熠闪光的短刀，口吞刀尖，身体向前倾斜，扑倒在地，很快就不再动弹，也停止了呼吸。
此刻的大广间内仅剩的武田一族女卷们的痛哭声几乎响彻整座要害山城。
而武田信玄的侧室弥津御料人、仓科里美等人还有武田一族的女卷、家中侍女、小姓、侧近等也都紧随武田信玄、三条夫人之后，纷纷拔出所携带的短刀，不是自刎就是互刺而亡。
因为他们每一个人心里都很清楚，若是自己被上杉军俘虏后的结局会是什么样的下场。辉虎和景定二人一定会听从信浓诸将们的建议拿他们来出气，必然会用武田家先前对待他们一样的做法来对自己。故而，他们在要害山城即将陷落之际都毫不犹豫的选择了自尽，以免之后受辱。
正所谓做事情不能做的太绝。不是不报，时候未到，时辰一到，诸事必报！欠下的血债，自然是要用血来偿还的！
若是武田家在信浓攻略中减少屠城、掠夺人口、杀降等暴行之举，想必其结局也不会是如此这般了。
灭甲斐者，甲斐也。族武田者，武田也。武田不暇自哀，而上杉哀之、鉴之。
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