朱由崧拿下盛京之后，就宣告了清政府的彻底灭亡。
这个由努尔哈赤奠基了几十年，由皇太极定鼎建立的大清王朝，从1636年算起，到目前的1650年，也即是弘光六年，前后只存在了14年，如果以统一王朝的时间来看，他在北京不到一年，又龟缩到了东北老家直到灭亡，比李自成的大顺王朝也强不到哪里去，堪称是昙花一现的统一政权。
由于朱由崧的穿越，彻底改变了大清的命运，就这样提前结束了他原本270多年的寿命。
这样从朱由崧御驾亲征率领远征军打出山海关之日算起，到现在整整3个月零几天的时间，不足一百天，朱由崧的大明仅三个月就灭了大清，堪称历史之传奇，铸造了远征军攻无不克，战无不胜，所向披靡的神话。
朱由崧旨意下，20多万远征军一部分进城，一部分仍留在城外。
朱由崧传令，严肃军纪，对城中的百姓不管是汉人，还是满洲人，还是蒙古人全都做到秋毫无犯，不得擅闯民宅，更不准杀戮，奸淫和抢劫。不论是谁违纪者，格杀勿论。
有的明军看押俘虏，有的张榜安民，宣传明军的政策，那些对大明仍然怀有旧感情的老百姓上街欢庆胜利，这主要是当地的辽人。
早有人把皇宫清理好了，朱由崧带着众臣僚及侍卫来到皇宫一看，大清的京师修建的真心不错，这座古城历经努尔哈赤和皇太极父子的修建，特别是后来多尔衮带着顺治帝和孝庄皇太后，被赶出北京之后，又回到了这里定都，又对之进行了扩建。
现在这里跟大明的皇城宫城规格布局一般无二，规模上也没有多大区别。绿瓦红墙，亭台楼阁，装点得金碧辉煌，以至于朱由崧君臣到了这里跟到了家一样，特别是小柳是，好几次都把这里当成了北京的紫禁城。
对努尔哈和赤皇太极的牌位，以及顺治帝，还有孝庄皇太后，多尔衮等人起居用具，朱由崧没有进行破坏，可能是他后世受过高等教育，把他们视为文物，以留作纪念。
出于这样的目的，朱由崧把皇城的东北角的几座阁殿腾了出来，按照原来的设计和位置，把这些东西摆放进去，让后人观展。
朱由崧在盛京城住了20多天，尽管现在是六月了，没有空调，也没有电扇，盛京城像春天一般温暖舒适，不冷不热的，估计又在十几度左右，这真是难得避暑胜地啊。
这20多天，朱由崧在盛京内外游览了个遍，盛京古城远非现在的沈阳城所能想象。没有沈阳城高度发达的经济和文明，却有着厚重历史文化的积淀。
还用了几天的时间，朱由崧到盛京城外，游山玩水。这里有山地，有丘陵，还有平原，风光宜人，不管是当地的辽人，还是稍远一些的女真人，蒙古人，现在全都成了大明的顺民，朱由崧在投降将士的引领下了解当地的风土人情和民族文化特色。
但是朱由崧不能在这多耽搁，大清虽然灭亡了，但是他的残余势力还存在。就像历史上崇祯上吊，李自成进北京，明朝灭亡了，但是明朝的残余势力在江南又延续了四帝一监国，至少四十年，如果算上民间的反清复明势力，以及后来吴三桂无耻的反清复明，那时间就更长。
清朝的残余势力当然是在东北，主要是蒙古边境，吉林，黑龙江一带，必须得尽快肃清。
朱由崧给漠北作战的黄得功传下一道旨意，一是褒奖他们作战勇敢，行动迅速，二是告诉他大清已经完蛋了，三也是最重要的，要求他们在内蒙古边境一带继续追歼大清残余，顺我者昌，逆我者亡，把大明的疆域向北扩展。
下一步，他要进军吉林和黑龙江一带。
这里本来就隶属于大明的奴儿干都司辖区范围，包括辽宁在内，涵盖黑吉辽三省，大明早期在东北的管辖范围甚广，永乐大帝设置的这一努儿干都司几乎涵盖了黑龙江，松花江，乌苏里江和嫩江等四江流域的广大地区，建州女真居住地和库页岛也全都包括在内。
只是近几十年来努尔哈赤父子的崛起，这里成了满清鞑子的摇篮，朱由崧现在通通要把它们收回来。
这一带有很多少数民族，似乎对大明有一定的感情基础，但是经过后金到大清，到大明这一个起伏，又是近半个世纪的时间，俗话说得好，穷山恶水出刁民。
大清灭了，难免会有刁民对大清怀旧，占据偏远，啸聚山林，对抗大明，也未可知。
必须对一片广大的地区进行梳理，清洗，彻底肃清满清鞑子的影响，将灭清战争进行到底。
另外灭掉大清只是他远征的第一步。他要亲自统领他的远征军，实现的伟大的目标:日光所照，皆为朕土；人只所称，皆为朕臣。
这20多天，盛京之战的战后事宜处理完了。兵马也得以休整，人马的伤亡得到及时的补充，军需粮草弹药也得到了补给，另外，现在这个季节正是行军打仗的好时节。
而且这20多天，北京的内阁首辅高弘图在请示朱由崧之后，驻守盛京的首任知府已经定下来了，他带领着地方三司衙门幕僚正在奉命往这里赶。
朱由崧留下了一名总兵官带几千人马驻守盛京，维持秩序，等待盛京知府和三司衙门等官员的到任。
然后朱由崧继续统帅20多万远征军，水陆并进，往东北方向深入。
仍然以李自成和张献忠为左路军和右路军大元帅，只是这次把远征军的马军和步军都一分为二，有李自成和张献忠各自统领一部分远征军的步军和马军。
2万远征军的特战兵，还有4000御营新军，由朱由崧亲自统领，作为中路军。三路人马离开盛京，向东北方向推进。5万水师营则沿松花江，牡丹江，嫩江和黑龙江等四江的主流和干流，配合岸上的三路大军向前推进。
四路大军势如破竹，所到之处当地的少数民族纷纷朝贡称臣，有的一看到大明的军队还非常高兴。
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